Pēc peptīdu nestabilitātes iemeslu izpratnes, pamatojoties uz gadu pieredzi peptīdu sintēzē, tika apstiprināts, ka ir šādi risinājumi peptīdu stabilitātes uzlabošanai.
1) Vietnes virzīta mutācija
Aizstājot atlikumus, kas izraisa peptīdu nestabilitāti, vai ieviešot atliekas, kas palielina peptīdu stabilitāti, izmantojot gēnu inženieriju, var uzlabot peptīdu stabilitāti.
2) Ķīmiskā modifikācija
Ir daudzas peptīdu ķīmiskās modifikācijas metodes, no kurām visvairāk pētīta ir PEG modifikācija. PEG ir ūdenī šķīstošs polimēru savienojums, kas bioloģiski noārdās un nav toksisks in vivo. PEG var uzlabot peptīdu šķīdību pēc saistīšanās, regulēt bioloģisko saderību, uzlabot termisko stabilitāti, pretoties proteāzes noārdīšanai, samazināt antigenitāti un pagarināt pussabrukšanas periodu in vivo. Piemērotu modifikācijas metožu izvēle un modifikācijas pakāpes kontrole var uzlabot fizisko sagatavotību vai uzlabot sākotnējo bioloģisko aktivitāti.
3) Piedevas
Pievienojot piedevas, piemēram, cukurus, poliolus, želatīnu, aminoskābes un noteiktus sāļus, var uzlabot peptīdu stabilitāti. Cukurs un polioli liek vairāk ūdens molekulām ieskaut proteīnus zemās koncentrācijās, tādējādi uzlabojot peptīdu stabilitāti. Liofilizācijas procesā iepriekš minētās vielas var arī aizstāt ūdeni un veidot ūdeņraža saites ar peptīdiem, lai stabilizētu to dabisko uzbūvi, kā arī var paaugstināt liofilizēto produktu stiklošanās temperatūru. Turklāt virsmaktīvās vielas, piemēram, SDS, Tween, Pluronic, var novērst peptīdu virsmas adsorbciju, agregāciju un nogulsnēšanos.
4) Saldēšanas žāvēšana
Ķīmisko reakciju sērija, kas notiek peptīdos, piemēram, deamidēšana, beta eliminācija, hidrolīze utt., prasa ūdens līdzdalību, kas var kalpot arī kā kustīga fāze citiem reaģentiem. Turklāt ūdens satura samazināšanās var paaugstināt peptīdu denaturācijas temperatūru. Tāpēc liofilizēšana var uzlabot peptīdu stabilitāti.